Fullafk.com – Koronavirüs SARS-CoV-2 üzerindeki başak proteinin yeni bir dinamik modeli, virüsün daha önce bilinmeyen koruyucu işlevini ve yeni potansiyel saldırı noktalarını ortaya koyuyor.

Max Planck Enstitüsü yeni koronavirüs saldırı noktası belirledi

Bir Alman araştırma ekibi, SARS-CoV-2 koronavirüsünün başak proteinindeki daha önce bilinmeyen bir saldırı noktasını ortaya çıkarmak için yeni bir analiz yöntemi kullandı. Ekip, bazı şeker moleküllerinin başak proteinini koruduğunu ve bağışıklık savunma hücrelerinin büyük bir bölümünü koruduğunu gösterdi. Bununla birlikte, çalışma grubu, hedeflenebilecek başak proteinin daha az iyi korunan alanlarını da keşfetti.

Frankfurt am Main’deki Max Planck Biyofizik Enstitüsü’ndeki araştırmacılar, sivri proteinleri bağışıklık savunma hücrelerinden koruyan virüsün koruyucu bir işlevini anlamak için dinamik bir SARS-CoV-2 modeli kullanabildiler. Soruşturma aynı zamanda virüsün koruyucu kalkanındaki zayıf noktaları da ortaya çıkardı. Sonuçlar yakın zamanda ünlü uzman dergisi “Plos” da sunuldu.

SARS-CoV-2’nin temel özelliği olarak başak protein

Çalışma grubunun vurguladığı gibi, başak proteini, SARS-CoV-2 koronavirüsünün temel bir özelliğidir, çünkü daha sonra onları enfekte etmek için protein yardımıyla hücrelerin yüzeylerine yapışabilir. Kapsamlı araştırmalar, koronavirüs ve onun yüksek proteininin ayrıntılı modellerinin oluşturulmasını sağlamıştır. Max Planck Enstitüsü’ndeki araştırmacılar şimdi bu modelleri daha da geliştirdiler.

Spike proteininin önceki modelleri statikti ve hareketi temsil edemiyordu. Yeni model ilk kez, spike proteininin ve çevreleyen glikan zincirlerinin hareketlerini simüle edebiliyor.

Ön cam sileceği gibi

Simülasyonlar, başak protein üzerindeki şeker moleküllerinin, virüsün insan bağışıklık sisteminden kaçmasına yardımcı olan dinamik bir koruyucu kalkan gibi davrandığını gösteriyor. Araştırmacılar, koruyucu işlevi, bir arabanın ön camını temizleyen bir ön cam sileceği ile karşılaştırıyor. Glikanlar, dik protein üzerinde ileri geri hareket ederek, nötralize edici antikorların başak proteinine yapışmasını önler.

Tüm yerler eşit şekilde korunmuyor

Bununla birlikte, araştırma aynı zamanda tüm konumların eşit derecede iyi korunmadığını da gösterdi. Bir ön cam sileceğine benzer şekilde, şeker molekülleri başak proteinin tüm alanlarını kapsamaz. Araştırmacılar, bazı bölgeler glikan kalkanı tarafından diğerlerine göre daha az korunmaktadır. Keşfedilen alanlardan bazıları önceki çalışmalarda zaten zayıf noktalar olarak tanımlanmıştı, diğerleri ise şimdiye kadar bilinmiyor.

SARS-CoV-2 mutasyonlarına karşı yeni başlangıç ​​noktaları

Araştırma ekibinden Mateusz Sikora, “SARS-CoV-2’nin yeni varyantlarının ortaya çıkmasıyla sürekli olarak değişen bir salgın aşamasındayız, mutasyonların özellikle spike proteininde yoğunlaştığı bir aşamadayız” diye açıklıyor araştırma ekibinden Mateusz Sikora. Yeni yaklaşım, özellikle halihazırda oluşturulmuş yöntemler başarısız olursa, aşıların ve terapötik antikorların tasarımını destekleyebilir.

Viral proteinler üzerindeki güvenlik açıklarını bulmak

Aynı zamanda, geliştirilen yöntem, diğer viral proteinler üzerindeki potansiyel zayıf noktaları bulmanın yeni bir yolunu da temsil ediyor, Max Planck Enstitüsü’ndeki araştırma ekibini özetliyor. Kısa bir süre önce, bir Amerikan araştırma ekibi, koronavirüsün spike proteininde başka bir zayıf nokta keşfetti: Bu konuda daha fazla bilgiyi şu makalede bulabilirsiniz: “COVID-19: Belirlenen virüste yeni zayıf nokta”.